MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 1004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	CCTT	2	8	2	9	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011264	TAA	2	6	27	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011264	TAT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
4	NC_011264	TAA	2	6	102	107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
5	NC_011264	T	6	6	118	123	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
6	NC_011264	TCC	2	6	210	215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288889
7	NC_011264	AATTT	2	10	216	225	40 %	60 %	0 %	0 %	203288889
8	NC_011264	CAA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
9	NC_011264	ATTA	2	8	316	323	50 %	50 %	0 %	0 %	203288889
10	NC_011264	TC	3	6	325	330	0 %	50 %	0 %	50 %	203288889
11	NC_011264	CTA	3	9	348	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
12	NC_011264	CATT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	203288889
13	NC_011264	TTGT	2	8	389	396	0 %	75 %	25 %	0 %	203288889
14	NC_011264	T	6	6	412	417	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
15	NC_011264	TCT	2	6	434	439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288889
16	NC_011264	TTCT	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	203288889
17	NC_011264	AATAA	2	10	468	477	80 %	20 %	0 %	0 %	203288889
18	NC_011264	TTA	2	6	491	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
19	NC_011264	TCA	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
20	NC_011264	TAA	2	6	604	609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
21	NC_011264	TTA	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
22	NC_011264	TCC	2	6	682	687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288889
23	NC_011264	TAC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
24	NC_011264	T	6	6	694	699	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
25	NC_011264	T	7	7	724	730	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
26	NC_011264	TCA	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
27	NC_011264	ACA	2	6	758	763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
28	NC_011264	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
29	NC_011264	ACA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
30	NC_011264	A	6	6	791	796	100 %	0 %	0 %	0 %	203288889
31	NC_011264	TAT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
32	NC_011264	AAT	2	6	821	826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
33	NC_011264	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
34	NC_011264	TAAA	2	8	870	877	75 %	25 %	0 %	0 %	203288889
35	NC_011264	T	6	6	878	883	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
36	NC_011264	CTT	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011264	TAA	2	6	912	917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011264	ATT	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011264	TAA	2	6	949	954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011264	TA	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011264	T	7	7	981	987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011264	T	6	6	1002	1007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011264	A	7	7	1011	1017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011264	TGA	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011264	ATA	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011264	AAAT	2	8	1060	1067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011264	ATT	2	6	1077	1082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011264	TAT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011264	A	6	6	1141	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011264	AT	3	6	1184	1189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011264	TAT	2	6	1193	1198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011264	ATA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011264	AAATA	2	10	1400	1409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011264	CTTTA	2	10	1463	1472	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011264	TTTA	2	8	1491	1498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011264	CTT	2	6	1593	1598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011264	TCA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011264	CTT	2	6	1628	1633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011264	TTG	3	9	1674	1682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011264	CTC	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011264	ACC	2	6	1735	1740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011264	CCT	2	6	1766	1771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011264	TCT	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011264	CTA	2	6	1798	1803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011264	TTTA	2	8	1808	1815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011264	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011264	CCT	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011264	TGA	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011264	TCC	2	6	1919	1924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011264	CTG	3	9	1931	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011264	CTT	2	6	1949	1954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011264	CCT	2	6	1975	1980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011264	GTT	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011264	CTG	3	9	2102	2110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011264	CAT	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011264	ATT	2	6	2184	2189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011264	CTA	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011264	TCT	2	6	2233	2238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011264	CTA	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011264	CGC	2	6	2325	2330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011264	ACA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011264	CTT	2	6	2447	2452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011264	AAT	2	6	2534	2539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011264	TTC	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011264	TAG	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011264	A	6	6	2615	2620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011264	CTT	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011264	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011264	CTC	3	9	2672	2680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011264	TTCC	2	8	2684	2691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011264	CAT	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011264	CAT	3	9	2727	2735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011264	TAC	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011264	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011264	TTC	2	6	2795	2800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011264	ATT	2	6	2928	2933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011264	CAA	2	6	2939	2944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011264	CTG	2	6	2981	2986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011264	TCTT	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011264	TCT	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011264	T	6	6	3039	3044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011264	AGC	3	9	3045	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011264	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011264	TAG	2	6	3083	3088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011264	AT	3	6	3128	3133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011264	TAT	2	6	3153	3158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011264	CTG	3	9	3167	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011264	TTG	2	6	3177	3182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011264	CTA	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011264	AAC	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011264	T	7	7	3231	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011264	AAT	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011264	T	6	6	3326	3331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011264	T	8	8	3341	3348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011264	TTTC	2	8	3356	3363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011264	T	8	8	3377	3384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011264	ATT	2	6	3385	3390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011264	TCT	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011264	AAG	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011264	A	6	6	3416	3421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011264	CAA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011264	ATG	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011264	CTAT	2	8	3449	3456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011264	A	7	7	3480	3486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011264	CT	3	6	3586	3591	0 %	50 %	0 %	50 %	203288890
126	NC_011264	CTT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
127	NC_011264	TTAA	2	8	3644	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	203288890
128	NC_011264	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
129	NC_011264	CTG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
130	NC_011264	CTT	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
131	NC_011264	TCC	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
132	NC_011264	CTG	3	9	3786	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
133	NC_011264	CCT	2	6	3833	3838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
134	NC_011264	CAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
135	NC_011264	ATT	2	6	3914	3919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
136	NC_011264	TCT	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
137	NC_011264	CTG	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
138	NC_011264	TAT	2	6	3955	3960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
139	NC_011264	CTG	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
140	NC_011264	CTG	2	6	3999	4004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
141	NC_011264	ACT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
142	NC_011264	T	7	7	4135	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	203288890
143	NC_011264	T	6	6	4292	4297	0 %	100 %	0 %	0 %	203288890
144	NC_011264	TTG	2	6	4332	4337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288890
145	NC_011264	TTA	2	6	4385	4390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
146	NC_011264	CTT	2	6	4490	4495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
147	NC_011264	TCC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
148	NC_011264	TCC	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
149	NC_011264	TTCC	2	8	4548	4555	0 %	50 %	0 %	50 %	203288890
150	NC_011264	CAT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
151	NC_011264	CAT	4	12	4591	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
152	NC_011264	AAT	2	6	4604	4609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288890
153	NC_011264	T	6	6	4633	4638	0 %	100 %	0 %	0 %	203288890
154	NC_011264	ATTC	2	8	4645	4652	25 %	50 %	0 %	25 %	203288890
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156	NC_011264	T	6	6	4667	4672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011264	T	7	7	4674	4680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011264	AAAT	2	8	4707	4714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011264	TA	3	6	4722	4727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011264	A	7	7	4748	4754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011264	A	6	6	4792	4797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011264	TC	3	6	4878	4883	0 %	50 %	0 %	50 %	203288891
163	NC_011264	TTAT	2	8	4892	4899	25 %	75 %	0 %	0 %	203288891
164	NC_011264	TCTAC	2	10	4916	4925	20 %	40 %	0 %	40 %	203288891
165	NC_011264	CTTA	2	8	4957	4964	25 %	50 %	0 %	25 %	203288891
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174	NC_011264	AGC	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288891
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179	NC_011264	TCA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
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182	NC_011264	TTC	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
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186	NC_011264	ATT	7	21	5810	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288891
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188	NC_011264	ATAAA	2	10	5862	5871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_011264	TATCT	2	10	5896	5905	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_011264	T	6	6	5926	5931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_011264	TTAC	2	8	5934	5941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_011264	ATT	2	6	5951	5956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_011264	ATT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011264	TCA	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_011264	A	7	7	8389	8395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011264	TAA	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_011264	TCC	2	6	8643	8648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
289	NC_011264	CCT	2	6	8674	8679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
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293	NC_011264	TCTCAA	2	12	8768	8779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
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329	NC_011264	AAAAT	2	10	9625	9634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_011264	TTTA	2	8	9679	9686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_011264	TTATT	2	10	9689	9698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_011264	CAT	2	6	11981	11986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_011264	ATT	3	9	11991	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_011264	TCCCT	2	10	12011	12020	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
410	NC_011264	T	7	7	12035	12041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_011264	AT	3	6	12048	12053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_011264	CCT	2	6	12063	12068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_011264	ATTT	2	8	12079	12086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_011264	T	7	7	12084	12090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_011264	A	6	6	12114	12119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_011264	TA	3	6	12274	12279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_011264	CTT	2	6	12286	12291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
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422	NC_011264	TCA	2	6	12361	12366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288894
423	NC_011264	CTT	2	6	12368	12373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
424	NC_011264	CTT	2	6	12461	12466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
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426	NC_011264	T	6	6	12569	12574	0 %	100 %	0 %	0 %	203288894
427	NC_011264	CAA	2	6	12576	12581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288894
428	NC_011264	CAA	2	6	12659	12664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288894
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433	NC_011264	CTT	2	6	12819	12824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
434	NC_011264	TCCT	2	8	12840	12847	0 %	50 %	0 %	50 %	203288894
435	NC_011264	ATT	2	6	12858	12863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288894
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440	NC_011264	CT	3	6	12926	12931	0 %	50 %	0 %	50 %	203288894
441	NC_011264	CCT	2	6	12944	12949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_011264	T	8	8	12952	12959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_011264	ATT	2	6	12960	12965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_011264	T	6	6	12964	12969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_011264	A	7	7	12992	12998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_011264	A	7	7	13053	13059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_011264	AAC	2	6	13599	13604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288895
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482	NC_011264	TAA	2	6	14387	14392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_011264	ATTA	2	8	15273	15280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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